Первым государственным собранием археологических предметов на территории нашего края стала коллекция древностей Курского губернского статистического комитета (КГСК). Среди собранных его сотрудниками предметов были кости и зубы мамонтов из Старооскольского и Обоянского уездов, 6 серебряных римских монет из клада у д. Гридасовой Обоянского уезда, греческие и римские сосуды, статуэтки, светильники, неизвестного происхождения, а так же 3 спиральных височных кольца, стеклянные и глиняные бусы, 2 перстня, 2 металлических «ушных» кольца, лунница, браслет, нож, костяная игла, два грузила от рыболовных сетей, заостренный кабаний клык и четыре глиняных сосуда, обнаруженные А.И. Дмитрюковым и Д.Я. Самоквасовым во время раскопок городищ и курганов в Суджанском уезде.
В декабре 1899 г. курский губернатор А.Д. Милютин предложил составить предварительный список собранных в КГСК древностей и «устроить временное хранилище означенных предметов с тем, чтобы впоследствии, когда представится возможность, организовать исторический кабинет и общедоступный музей в целях изучения прошлого Курской губернии в связи с современным ее состоянием и в целях популяризации сведений о ней».
Спустя два года, 3 декабря 1901 г., на общем собрании сотрудники КГСК было принято решение о создании историко-археологической комиссии, одним из основных направлений деятельности которой становится пополнение существующего хранилища и создание на его базе исторического кабинета или музея. Хранителем коллекций был назначен секретарь КГСК Н. И. Златоверховников. В 1902 г. новый курский губернатор Н.Н.Гордеев после долгого и детального осмотра собранных в хранилище Курского губстаткомитета предметов, отметил, что «этого очень мало, чтобы устроить музей; нужно собрать коллекции, отвечающие вполне его назначению». Решив оказать делу популяризации курской истории самую действенную поддержку Н.Н.Гордеев во время аудиенции у императора Николая II «имел счастье верноподданейше представить свои предположения об устройстве в Курске историко-археологического и кустарного музея, связанного с памятью о последнем историческом событии губернии – пребывании здесь его Императорского Величества в 1902 г. Государю Императору благоугодно было сочувственно отнестись к этому предположению и повелеть отпустить десять тысяч рублей на первоначальное оборудование музея».
23 апреля 1903 г. было объявлено об учреждении Курского историко-археологического и кустарного музея, а через два года, 18 января 1905 г., состоялось его открытие. В одном из отделов музея – Палеонтологическом – размещались и археологические экспонаты: две огромные витрины «с результатами раскопок Гочевского городища Обоянского у. и его могильника, произведенных известным профессором Московского университета Д.Я. Самоквасовым 18 – 26 августа 1909 г.», рядом с которыми размещался портрет знаменитого российского археолога, каменная баба, «изваяние какого-то чудовища, известного под названием Курский сфинкс», бивни мамонта, предметы из курганов, раскопанных у Дроголева городища рядом с с. Волынцево Путивльского уезда (до 1924 г. входил в состав Курской губ., совр. Сумская обл., Украина), предметы с городища и могильника у с.Гнездилова, из курганов Суджанского и Рыльского уездов, материалы раскопок Курской Губернской Ученой Архивной Комиссии в Курском уезде 27 мая – 3 июня 1907 года и коллекция греко-римских древностей.
В мае 1925 г. историко-археологический музей был объединен с музеем искусств и вошел в состав единого Курского губернского краеведческого музея (с 30 сентября 1930 года – Курский областной краеведческий музей), в фондах которого долгое время хранились археологические коллекции, а в нескольких залах была развернута экспозиция, посвящённая древнейшей истории Курского края. В начале 1990 г. в Курском областном краеведческом музее был образован отдел археологии, осенью этого же года занявший первый этаж Нижне-Троицкой церкви, где началось создание археологической экспозиции.
